本书分为神农尝百草、伤寒杂病论、金匮要略、黄帝内经集注四部分，主要包括：《神农本草经》序、上经(上品)、中经(中品)、下经(下品)、《伤寒杂病论》序、平脉法、六气主客、伤寒例、杂病例等。